Hajime Kindaichi uczęszcza do liceum Fudo, w którym krążą plotki o siedmiu tajemnicach. Mówi się, że każdy, kto pozna szczegóły siódmej tajemnicy, zostanie przeklęty i zabity przez upiora ze świetlicy, który czai się w starym budynku szkoły. Miyuki Nanase z Klubu Tajemnic zagłębia się w te tajemnice. Pewnej nocy do Miyuki dzwoni Sakuragi i razem udają się do starego budynku szkoły. Gdy docierają do zamkniętej sali biologicznej, wydaje im się, że widzą wiszące zwłoki Sakuragi! Widzą również cień upiora ze świetlicy, ale gdy wyważają drzwi i wchodzą do środka, nic tam nie ma. Jednak następnego dnia zostają odnalezione zwłoki Sakuragi. Inspektor Kenmochi, Saki i pozostali członkowie Klubu Tajemnic, Tachibana i Matoba, rozpoczynają śledztwo. Miyuki żałuje, że poznała siedem tajemnic, i zdaje sobie sprawę, że może być kolejną ofiarą. Co więcej, zaginął uczeń, który badał tajemnice dziesięć lat wcześniej.
